Τα εσωτερικά του Βυζαντινού και Χριστιανικού Μουσείου καθοδηγούν τον επισκέπτη μέσα από εικόνες, λειτουργικά αντικείμενα, τοιχογραφίες και θρησκευτικές μαρτυρίες. Η διαδρομή δείχνει πώς ο χριστιανισμός έχει αλλάξει τη γλώσσα της τέχνης, της εξουσίας και της ελληνικής ταυτότητας.